Como publicado na postagem anterior, modelagem molecular , segundo a IUPAC, é a investigação das
estruturas e das propriedades moleculares pelo uso da química computacional e
técnicas de visualização gráfica, visando fornecer uma representação
tridimensional, sob um dado conjuntos de circunstancias. O planejamento de
fármacos auxiliado por computador é descrito em diversas paginas da internet e
auxilia, com tutoriais, a investigação das interações químicas de um ligante
com o seu receptor e exploração dos fatores estruturais relacionados ao efeito
biológico.
A disponibilidade de programas computacionais de química o
os bancos de dados em rede são, atualmente, ferramentas fundamentais para a
descoberta e planejamento de fármacos. Estas informações permitem uma analise
rápida da atividade biológica, propriedades físico-quimicas de uma serie de
moléculas de interesse. Novos agentes terapêuticos podem ser desenvolvidos pela
análise de dados teóricos de estrutura-atividade de forma tridimensional ,
obtidos por técnicas recentes de modelagem molecular
compreende um número de ferramentas e
métodos computacionais e teóricos que tem como objetivo estudar e prever o
comportamento de sistemas biológicos e químicos. Ela descreve estruturas de
biomacromoléculas, como proteínas, DNA, e de moléculas pequenas, como fármacos
e inseticidas; estuda propriedades do estado de transição e equilíbrio de
reações químicas, propriedades termodinâmicas, entre outras.
Qual a importância da modelagem molecular para os fármacos?
A MM fornece
informações importantes para o processo de planejamento de fármacos. Ela
permite a obtenção de propriedades específicas de um composto que podem
influenciar na interação com seu receptor. Como exemplo, pode-se citar o mapa
de potencial eletrostático, o contorno da densidade eletrônica e as energias e
os coeficientes dos orbitais de fronteira HOMO e LUMO. Outras informações
importantes também podem ser obtidas a partir da comparação estrutural entre
diferentes moléculas, o que permite a geração de um índice de similaridade que
pode ser correlacionado com a atividade farmacológica. Esses métodos computacionais auxiliam
estudos de minimização de energia, otimização geométrica, análise
conformacional, simulações de dinâmica molecular, docking ligante-proteína,
entre outros; e são aplicáveis de átomos isolados a biomacromoléculas, sendo
atualmente indispensáveis no estudo de propriedades de candidatos a fármacos e
no planejamento destes.
Referências
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